在電場的作用下將電泳分離的多肽從凝膠轉移至一種固相支持體，然后用這種多肽的特異抗體來檢測。
Western blot的中文名稱是：蛋白質印跡,也叫免疫印跡（immunoblotting)。是分子生物學中常用的三種印跡技術之一。目前*的該實驗技術的發(fā)明人為美國斯坦福大學的喬治·斯塔克（George Stark）。
Western blot——蛋白質印跡
Southern blot——DNA印跡
Northern blot——RNA印跡
高分辨率的電泳技術
特異敏感的抗原-抗體反應
1-5ng中等大小的靶蛋白
目的蛋白的表達特性分析
目的蛋白與其它蛋白的互作
目的蛋白的組織定位
目的蛋白的表達量分析
提取細胞中的蛋白多是利用將細胞裂解、破碎、使蛋白質釋放的原理。其中裂解液應該新鮮制備，加入少量的蛋白酶抑制劑以減少蛋白的降解，并且分裝凍存于-80℃，蛋白酶抑制劑的種類很多，要根據(jù)具體情況選擇。
目的：要獲得高豐度、高品質的蛋白質，以滿足后續(xù)實驗的需求。
Western blot作為一項半定量實驗技術，電泳前，必須盡量使各組之間總蛋白量基本一致;
蛋白質總量不足可能妨礙對目的蛋白的鑒定; 蛋白質含量太高則會使帶形扭曲,甚至會影響此電泳方法的分辨力。
目前常用比色法測定樣品蛋白的含量：Bradford法（考馬斯亮藍法）、Lowry法（Folin-酚試劑法）、BCA法等。
1M Tris-HCl(pH6.8) | 10 ml |
1M DTT | 20 ml |
SDS | 4 g |
甘油 | 20 ml |
溴酚藍 | 0.2 g |
總體積 | 100ml |
全部配好分裝，-20℃凍存。
按1:1比例與蛋白質樣品混合，95～100℃加熱5～15min，冰上冷卻后再上樣，上樣量一般為20-25μl，總蛋白量20～50μg。
SDS：
陰離子去污劑 變性劑
氨基酸側鏈與SDS充分結合形成帶負電荷的蛋白質-SDS膠束。
蛋白質-SDS膠束所帶的負電荷大大超過了蛋白質分子原有的電荷量，消除了不 同分子之間原有的電荷差異。
與強還原劑一起使蛋白分子氫鍵、疏水鍵打開，使蛋白質分子線性化。
蛋白質-SDS膠束的特點：
不連續(xù)的電泳緩沖體系。
SDS—蛋白質復合物在凝膠電泳時，不再受蛋白質電荷與形狀的影響，而只取決于蛋白質分子量的大小。
SDS聚丙烯酰胺凝膠配制及蛋白分離范圍
灌膠
灌制分離膠 隔絕空氣 灌制濃縮膠 插入梳子
加足夠的電泳液后開始準備上樣。（電泳液至少要漫過內測的小玻璃板。）用微量進樣器貼壁吸取樣品（Marker： 5-10ul ；樣本：10 ul ）。將加樣器針頭插至加樣孔中緩慢加入樣品。加樣太快可使樣品沖出加樣孔，若有氣泡也可能使樣品溢出。加入下一個樣品時，進樣器需在外槽電泳緩沖液中洗滌3次，以免交叉污染。
采用恒壓的方法：1.恒壓60V，至樣本跑過 濃縮膠；2.將電壓調至120V至溴酚蘭剛跑出即可終止電泳，準備進行進行轉膜。
凝膠電泳結束后，將凝膠上分離的蛋白條帶通過轉移電泳方式轉印至固相支持物上，常用的固相支持物有NC （硝酸纖維素）膜、尼龍膜及PVDF（聚偏氟乙烯）膜。
選擇膜的主要根據(jù)有：
1.膜與目的蛋白分子的結合能力（也就是單位面積的膜能結合蛋白的載量）
2.膜的孔徑（也就是攔截蛋白的大小）
3.不影響后續(xù)的顯色檢測（也就是適合用于所選顯色方法，信噪比好）
4.如果后繼實驗有其他要求，比如要做蛋白測序或者質譜分析，還要根據(jù)不同目的來挑選不同的轉移膜
濕轉系統(tǒng)
轉一張膜需準備濾紙和1張轉印膜。切濾紙和膜時一定要戴手套，因為手上的蛋白會污染膜。轉膜前，轉印膜以及濾紙均需浸潤在電轉液中活化15-20min（其中PVDF膜需在無水甲醇中活化30min后再浸潤于電轉液中，且濾紙應與膠和膜的大小一致）。
將玻板輕輕撬開，將凝膠剪裁后從玻板上移至電轉液中。從陰極到正極，按照三層濾紙 凝膠 轉印膜 三層濾紙的順序制成“三明治”（濕轉在三明治的兩側各加一層活化過的海綿，同時應注意去除膜、凝膠和濾紙之間的氣泡）。
半干轉移系統(tǒng)
轉完后將膜用1×麗春紅染液染5min（于脫色搖床上搖）。然后用水沖洗掉沒染上的染液就可看到膜上的蛋白，將膜晾干備用。
將凝膠用考馬斯亮藍染色，觀察凝膠中的蛋白是否*轉至印跡膜上。
封閉
為避免作為檢測試劑的特異性抗體與膜發(fā)生非特異性結合，使非特異性背景提高，需對膜上的潛在結合位點進行封閉處理。
5%脫脂奶粉或BSA（室溫孵育1h）
Tween-20的作用：減少非特異性吸附，不影響抗體與抗原的結合。
一抗孵育
把膜放在密閉塑料袋或者培養(yǎng)皿中，根據(jù)膜面積以0.1mL/cm2的量加入一抗溶液，搖床上平緩搖動，于室溫孵育1-2小時或4℃過夜。
回收一抗溶液，用TBST漂洗膜3次，每次10min。
二抗孵育
加入二抗，搖床上緩慢搖動，于室溫孵育1-2小時或4℃過夜。
用TBST漂洗膜3次，每次10min。
后用TBS漂洗膜2次，每次10min。
利用ECL（增強化學發(fā)光）發(fā)光檢測目的蛋白。
ECL試劑采用氧化還原反應的原理：
發(fā)光液A和B分別是魯米諾和過氧化氫，在辣根過氧化物酶（HRP）的催化作用下,魯米諾與過氧化氫反應生成一種過氧化物，過氧化物不穩(wěn)定隨即分解，形成一種能發(fā)光的電子激發(fā)中間體,當后者由激發(fā)態(tài)返回至基態(tài)，就會產生熒光。
目的蛋白的灰度值除以內參的灰度值以校正誤差，所得結果代表某樣品的目的蛋白相對含量。
內參的選擇
內參即是內部參照，對于哺乳動物細胞表達來說一般是指由管家基因編碼表達的蛋白，它們在各組織和細胞中的表達相對恒定，一般要選擇一個在處理因素作用的條件下蛋白含量不會發(fā)生改變的蛋白作內參。
內參起著校正總蛋白上樣量的重要作用，只有在內參條帶基本均勻一致的情況下，目的蛋白條帶出現(xiàn)的差異才有意義,表明的確是實驗設計的干預因素造成目的蛋白量的變化，而不是加樣誤差造成目的條帶含量的變化。
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